司马睿对着王导跷起了大拇指：“到底是相国啊，高，实在是高，而且够狠！”
就这样，周玘在司马睿和王导的设计下开始了江浙沪来回跑，跑了好几趟后，周玘知道司马睿已经获悉自己的计划了，就是想遛死自己。愤懑之下的周玘病倒了，并很快含恨离世，时年五十六岁，死后被追谥为辅国将军。
一代名将，为东晋开国奠定了军事基础的周玘就死得如此悄无声息，而在他死后，东晋王朝也刻意地淡化他的功绩，直到今天，已经不会再有多少人知道这位曾经挽救汉文明的英雄了。周玘死前曾经对儿子周勰咬牙切齿地说道：“杀害我的是那群刚波佬（江北佬），你他日若能报了父仇，便是周家的好儿子！（杀我者诸伧子，能复之，乃吾子也。）”
周玘死后，周勰没有忘记父亲的教诲，曾经利用江东士族对北来侨民的不满再次打出“诛杀王导、刁协，清君侧”的口号。只不过那时东晋已经建国，在江东的统治也是日益稳固，而周勰也没有其父的威信，复仇计划无果而终。
司马睿考虑到吴人对于周家的崇敬和同情，对于周勰也没有赶尽杀绝，只是将其免职处理。当然，琅邪王家对于义兴周家的迫害却并没有停止，以后我们还会说到。